Resumo A estrutura de assembleias de água doce pode ser influenciada diretamente pela urbanização ou indiretamente por reduções em heterogeneidade ambiental (HA). Para separar os efeitos da urbanização dos da HA, variáveis substitutas a esses processos precisam ser não-correlacionadas. Avaliamos os efeitos do grau de urbanização e HA na estrutura das assembleias de peixes. Amostramos peixes em 45 riachos localizados na área urbana de Cuiabá. Avaliamos os efeitos da urbanização e HA na riqueza rarefeita de espécies de peixes (Srarefeita), contribuição local para a diversidade beta (LCBD) e composição de espécies utilizando modelos lineares e análise de redundância baseada em distância. Nossos índices de urbanização e HA não foram correlacionados. Observamos que tanto a Srarefeita e a LCBD diminuíram com aumentos no grau de urbanização, mas não foram correlacionadas com a HA. Também observamos que as abundâncias de poucas espécies de peixes nativos correlacionaram-se com HA. Serrapinnus microdon, S. calliurus, Hemigrammus tridens e Astyanax lacustris foram mais abundantes em riachos com menor grau de urbanização. A não-nativa Poecilia reticulata foi mais abundante em riachos com maior grau de urbanização. Nossos resultados destacam que a urbanização resulta em impactos negativos nas assembleias de peixes, tais como reduções da diversidade e a dominância de espécies não-nativas.

Abstract The structure of freshwater assemblages may be driven directly by urbanization or indirectly by a reduction in environmental heterogeneity (EH). Disentangling the effects of urbanization and EH requires uncorrelated proxies of each of these factors. We assessed the effects of the degree of urbanization and EH on the structure of fish assemblages. We sampled fish in 45 streams located in the urban area of Cuiabá. We assessed the effects of urbanization and EH on rarefied fish species richness (Srarefied), the local contribution to beta diversity (LCBD), and composition with linear models and distance-based redundancy analysis. Our indexes of urbanization and EH were not correlated. We found that both Srarefied and the LCBD decreased with an increasing degree of urbanization, but were not associated with EH. We also noted that few native fish species abundances were associated with the EH. Serrapinnus microdon, S. calliurus, Hemigrammus tridens, and Astyanax lacustris were abundant in streams with a lower degree of urbanization. The non-native Poecilia reticulata was more abundant in streams with a higher degree of urbanization. Our results highlight that urbanization leads in negative impacts on fish assemblages, such as decreases in diversity and the dominance of non-native species.

Resumen Hay poca información sobre la inmunidad innata de los triatominos contra Trypanosoma rangeli, un parásito infeccioso para el humano, aunque no patógeno, y T. cruzi, el agente causal de la enfermedad de Chagas. En este trabajo se buscó llenar ese vacío mediante el estudio de la actividad tripanolítica in vitro de la hemolinfa de insectos no infectados con T. rangeli o T. cruzi. Se examinaron ocho especies de triatominos: Rhodnius prolixus, R. robustus, R. colombiensis, R. pallescens, R. pictipes, Triatoma dimidiata, T. maculata, y Panstrongylus geniculatus. La hemolinfa de las colonias de laboratorio de R. prolixus y R. robustus presentó una fuerte actividad tripanolítica durante las primeras 14 horas de incubación con los parásitos, evidenciando 81 y 90 % de lisis para los genotipos C y E de T. rangeli y 95 % para la unidad taxonómica discreta (DTU) de TcII, 94 % para TcV, 96% para TcVI, 94 % para Tcbat y 90 % para Tcmarinkellei. No se detectó lisis a las 14 ni a las 24 horas de incubación de los parásitos con las hemolinfas de colonias de laboratorio de R. pictipes, R. pallescens, P. geniculatus y T. maculata. Se registraron resultados idénticos (ausencia de lisis) con la hemolinfa de colonias de laboratorio de R. colombiensis y T. dimidiata y de especímenes capturados en ambientes selváticos. La actividad lítica de la hemolinfa fue similar en cultivos recientes de TcII (95 % de lisis) y en aquellos mantenidos por periodos prolongados (96 % de lisis). La actividad lítica de la hemolinfa de R. prolixus fue similar en ninfas, machos y hembras y en insectos alimentados con sangre de gallina o sangre de ratón. Este es el primer estudio comparativo de la actividad tripanolítica en la hemolinfa de diferentes especies de triatominos contra genotipos de T. rangeli y T. cruzi. Aunque la estructura química de los factores líticos, así como los mecanismos que determinan su expresión, aún no se han establecido completamente, su identificación permitirá comprender mejor la inmunidad innata de los triatominos y su papel en la trasmisión de los tripanosomas.

Abstract There is limited information about the innate immunity of triatomines against Trypanosoma rangeli, an infectious, non-pathogenic human parasite, and T. cruzi, the causative agent of Chagas' disease. This study aimed at addressing this gap by studying the in vitro trypanolytic hemolymph activity from insects not infected by T. rangeli or T. cruzi. Eight triatomine species were examined including Rhodnius prolixus, R. robustus, R. colombiensis, R. pallescens, R. pictipes, Triatoma dimidiata, T. maculata, and Panstrongylus geniculatus. The hemolymph of R. prolixus and R. robustus laboratory colonies demonstrated strong trypanolytic activity during the first 14 hours of parasite incubation with 81% lysis for the T. rangeli C genotype, 90% for the E genotype, 95% for T. cruzi discrete taxonomic unit (DTU) TcII, 94% for TcV, 96% for TcVI, 94% for Tcbat, and 90% for Tcmarinkellei. No lysis activity was detected 14 or 24 hours after parasite incubation with the hemolymph of insects from R. pictipes R. pallescens, P. geniculatus, and T. maculata colonies. Identical results (absence of lysis) were observed using hemolymph from R. colombiensis and T. dimidiata laboratory colonies and specimens captured in sylvatic environments. The hemolymph lytic activity against recently obtained cultures (95% decrease in live parasite count) and long-term T. cruzi TcII ones (96% decrease) was similar. Lytic activity was similar in hemolymph from R. prolixus nymphs, males and females and insects fed on chicken or mouse blood. This is the first comparative study of the trypanolytic activity of hemolymph from different triatomine species against T. rangeli and T. cruzi genotypes. Although the chemical structures of such lysis factors and the mechanisms determining their expression have not been fully determined, their identification furthers our understanding of triatomines' innate immunity and their role in Trypanosoma transmission.

Resumen Este estudio integró las características ecomorfológicas y la ecología trófica de Triportheus magdalenae en el embalse El Guájaro, Atlántico, bajo Magdalena, Colombia, a partir del análisis del contenido estomacal y rasgos ecomorfológicos. Se realizaron cinco muestreos entre septiembre 2014 y febrero 2016 para abarcar cada momento del pulso de inundación. La recolecta de los peces fue a través de artes de pesca tradicional como atarrayas y redes de arrastre. Se utilizó el índice alimentario (IAi %) para establecer los hábitos alimentarios de la especie, y la variación de la dieta a nivel interespecífico, y se usó el coeficiente de vacuidad (CV %). Se emplearon los índices de Levins Estandarizado por Hurlbert (BA) e índice de Morisita Simplificado para evaluar la amplitud y similitud trófica entre tallas, sexo y momentos hidrológicos. Se caracterizó las estructuras bucofaríngeas y el tracto digestivo, que junto con medidas morfológicas permitieron establecer y analizar 11 rasgos ecomorfológicos relacionados con el uso del hábitat como posición en la columna de agua y la explotación del recurso trófico. Se analizó la relación entre los rasgos ecomorfológicos con la dieta de la especie, por medio de un análisis de correspondencia canónica (ACC). Se analizaron 89 ejemplares (34-190 mm LE). T. magdalenae fue catalogado como carnívoro-zooplanctófago, con un estrecho nicho trófico (BA = 0.12). Se evidenció una alta explotación de los organismos del zooplancton (95.9 IAi %), intensivamente Cladócera (Ceriodaphnia sp.) y Copépoda (Notodiaptomus sp. y Thermocyclops sp), los juveniles (34-190 mm LE) consumieron intensamente los insectos alóctonos (3.4 IAi %). Los rasgos que más aportan a la especialización trófica fueron la longitud relativa de las branquiespinas y el número de branquiespinas, los cuales varían significativamente entre tallas, ya que aumentan en número como en longitud conforme los individuos crecen. El coeficiente de vacuidad fue alto del 54 %, lo cual pudo estar asociado con la disminución en la densidad de las poblaciones de zooplancton, especialmente durante el momento de aguas mínimas fuertemente influenciado por el evento El Niño, sin embargo la dieta observada (22 ítems alimentarios) correspondió al 80 % de la dieta estimada (28 ítems alimentarios estimados).

Abstract This study integrated morphological characteristics and trophic ecology of Triportheus magdalenae in the El Guájaro reservoir, Atlántico, lower Magdalena River Basin, Colombia, based on the analysis of stomach contents and ecomorphological attributes. Five samplings were made between September 2014 and February 2016 considering each phase of the flood pulse. The fish were sampled using traditional fishing gear such as nets and trawls. The index of food importance (IAi %) was used to establish the dietary habits of the species, and the variation of the diet at interspecific level, and the vacuity coefficient (CV %) was also calculated. The Levins index standardized by Hurlbert (BA) was used to evaluate the amplitude between sizes, sex and hydrological phases. The oropharyngeal structures and the digestive tract were characterized, which together with morphological measurements, allowed and analyze 11 ecomorphological traits related to the use of habitat, such as position in the water column, and the exploitation of a particular trophic resource. The relationship between the ecomorphological traits and the diet of the species was analyzed by canonical correspondence analysis (CCA). We analyzed 89 individuals (34-124 mm SL). Triportheus magdalenae was classified as carnivore/zooplanktivore, and has a narrow trophic niche (BA = 0.12). Showed a high exploitation of zooplankton (95.9 % IAi), mostly Cladocera (Ceriodaphnia sp.) and Copepoda (Notodiaptomus sp. and Thermocyclops sp). The youngest juveniles (34-190 mm SL) also consumed allochthonous insects (3.4 % IAi). The ecomorphological traits that contributed the most to this trophic specialization were the relative length of the gillrakers (LRBE). The number of gillrakers (NBE), which varied significantly from the smaller to the larger ones, increase in both number as well as in length as individuals grow, which explains the strongly marked degree of specialization on zooplankton in adults, since they present a greater degree of efficiency in the process of filtering. The vacuity coefficient was high (54 %), which could be associated with a decrease in the density of zooplankton populations, especially during the time of lower waters strongly influenced by the El Niño event, however the observed diet (22 items food) corresponded to 80 % of the diet estimated (28 estimated food items). Rev. Biol. Trop. 66(3): 1208-1222. Epub 2018 September 01.

ResumenLos estudios sobre la ecología trófica de las especies permiten reconocer los diferentes grupos tróficos, importancia de los niveles tróficos y las interrelaciones que existen entre sus componentes y los demás miembros de la comunidad. Es común en peces emplear el análisis del contenido estomacal como una herramienta útil desde el punto de vista ecológico. En esta investigación se estudiaron los hábitos alimenticios, variación alimenticia y relaciones tróficas de los peces presente en arroyos del corregimiento del Corral de San Luis, Tubará, Atlántico, cuenca del bajo Rio Magdalena, Caribe, Colombia, a partir del análisis del contenido estomacal, entre noviembre 2012 y octubre 2013. Para la recolecta de los peces se empleó una la red de arrastre (2x5 m, ojo de malla de 0.5 cm), se reportó in situ variables fisicoquímicas. En el análisis del contenido estomacal se utilizó el método numérico (% N), volumétrico (% v) y frecuencia de ocurrencia (% FO), coeficiente de vacuidad (C.v) e índice de importancia alimentaria (i.A). La información se procesó por medio de análisis multivariados, índices ecológicos y modelos nulos: análisis de correspondencia canónica (ACC), análisis de componentes principales (ACP), amplitud del nicho trófico (ShannonWeaver H´) y solapamiento trófico (Morisita-Horn). La ictiofauna se conformó por Awaous banana, Agonostomus monticola, Andinoacara latifrons, Hyphessobrycon proteus, Poecilia gillii, Gobiomorus dormitor y Synbranchus marmoratus. Las especies mostraron diferencias significativas (K-W= 20.86; p<0.05) con respecto al consumo del recurso trófico. Fueron clasificados según sus hábitos tróficos como: omnívoros con tendencia a la insectivoría (A. monticola H´0.60; A. latifrons H´0.43), herbívoros con tendencia a la alguivoría (A. banana H´0.50; P. gillii H´0.54) y carnívoro con tendencia a la insectivoría (H. proteus H´0.23), donde los invertebrados bentónicos y las microalgas son los recursos tróficos más importantes. Un total de 65 ítems alimenticios fueron determinados 21 en A. banana (2 únicos, 19 compartidos), 40 en A. monticola (21 únicos, 19 compartidos), 19 en A. latifrons (5 únicos, 14 compartidos), 6 en H. proteus (1 único, 5 compartidos) y P. gillii con 28 (4 únicos, 24 compartidos). El análisis de correspondencia canónica mostró a la conductividad, la salinidad y el pH como las variables con una relación directa sobre la estructura del ensamblaje de los peces en los sitios de muestreo. Los modelos nulos muestran que el grupo de peces se encontraban significantemente segregados (p=0.001) en el eje trófico con respecto a los ítems alimenticios compartidos, dicha segregación no está influenciada o generada por la competencia; el índice de Morisita-Horn mostró un falso solapamiento trófico (similitud del 80 % aprox.) entre A. banana y P. gillii. El ACP fue explicado en el primer componente principalmente por fitoplancton, mientras en el componente dos se correlacionó con ítems de origen animal, los peces asociados al CP1 son P. gillii con altos valores en la ingesta de microalgas, y A. banana, el CP2 fue explicado por A. monticola la cual se correlacionó con los altos valores en ítems de origen animal. El grupo de peces estudiados se comportan como un ensamblaje ya que la interrelación trófica corresponde a un falso solapamiento trófico y estas no se excluyen unas a otras dentro del ecosistema, utilizando diferentes recursos alimenticios con diferencias espaciales.

AbstractEcological studies of species, such as the stomach content analysis, allow us to recognize different trophic groups, the importance of trophic levels and the interrelationships among species and other members of the community. in this investigation, we studied food habits, feeding variation and trophic relationships of the fishes present in streams of the Corral de San Luis drainage, Tubará, Atlántico Department, a part of the lower Magdalena River Basin in Colombian Caribbean. Fish samples of Awaous banana, Agonostomus monticola, Andinoacara latifrons, Hyphessobrycon proteus, Poecilia gillii, Gobiomorus dormitor and Synbranchus marmoratus were obtained using a seine (2x5 m, mesh 0.5 cm), from November 2012 to October 2013. To analyze their stomach contents, we used numeric (% N), volumetric (% v) and frequency of occurrence (% FO) methods, an emptiness coefficient (C.v), index of food item importance (i.A). Besides, physical and chemical habitat parameters were recorded on site. information obtained was processed using multivariate statistical analysis, ecological indices, and null models: canonical correspondence analysis (CCA), principal component analysis (PCA), trophic niche amplitude (Shannon-Weaver H´) and trophic overlap (Morisita-Horn). We observed significant differences on food resources consumption (K-W= 20.86; p<0.05) among the studied species. They were classified according to their food habits as omnivores with a tendency towards insectivory (A. monticola H´0.60; A. latifrons H´0.43), herbivores with a tendency towards the consumption of algae (A. banana H´0.50; P. gillii H´0.54) and carnivores with a tendency towards insectivory (H. proteus H´0.23); benthic invertebrates and microalgae were found the most important food sources. A total of 65 food items were identified in this study: 21 for A. banana (2 unique, 19 shared), 40 for A. monticola (21 unique, 19 shared), 19 for A. latifrons (5 unique, 14 shared), 6 for H. proteus (1 unique, 5 shared) and P. gillii with 28 (4 unique, 24 shared). The canonical correspondence analysis showed that water conductivity, salinity and pH were the variables that directly influenced fish community structure at the sampled sites. The null model analyses showed that the group of fishes was significantly segregated (p= 0.001) along the trophic axis, with respect to shared food items, and that the segregation was not influenced or generated by competition. The Morisita-Horn index showed false trophic overlap (similarity of about 80 %) between A. banana and P. gillii. The first component of the PCA analysis was explained mainly by phytoplankton, and component two was correlated with items of animal origin. The fishes associated with PC1 were P. gillii and A. banana, with high ingestion values of microalgae. PC2 was explained by A. monticola with high numbers of food items of animal origin. The group of fishes studied behaved as an assemblage; given that the trophic interrelationships showed false trophic overlap, and that they did not exclude one another from the ecosystems, but instead, used different food resources and different physical spaces within their habitat. Rev. Biol. Trop. 64 (2): 715-732. Epub 2016 June 01.

This article presents a comparison of the performance of the tools Hadoop y Giraph for the analysis and processing of large volumes of information or Big Data, with the aim of showing their usefulness for Big Graph processing. The analysis and processing of large volumes of information represents a real challenge nowadays. There already exist Big Data methodologies and free processing tools such as those mentioned above: Hadoop for processing large volumes of data, mainly non-related data, and recently Giraph for processing large graphs or Big Graph. In this comparison, this paper presents an analysis of the execution time cost for the practical implementation of the PageRank algorithm, which classifies Web pages according to their relevance, and of algorithms to find the minimum spanning tree in a graph. Experiments show that the use of Giraph for processing Big Graphs reduces the execution time by 25% with respect to the results obtained using Hadoop.

Este artículo presenta una comparativa del rendimiento de las herramientas Hadoop y Giraph para de procesamiento de grandes volúmenes de información o Big Data con el fin mostrar su utilidad para el procesamiento de Big Graph. El análisis y procesamiento de grandes volúmenes de información representa un verdadero desafío en la actualidad. Ya existen metodologías y herramientas libres para el procesamiento de Big Data como las mencionadas: Hadoop para el procesamiento de grandes volúmenes de datos, principalmente no estructurados, y Giraph para el procesamiento de grandes grafos o Big Graph. En esta comparativa, este trabajo presenta un análisis del costo en tiempo de ejecución práctico de la implementación del algoritmo PageRank, el cual permite clasificar páginas Web según su relevancia, y de algoritmos para encontrar un árbol de expansión mínima en un grafo. Los experimentos muestran que el uso de Giraph para el procesamiento de Big Graph reduce el tiempo de ejecución en un 25% respecto a los resultados con el uso de Hadoop.

In this paper the modular approach of aspect-oriented programming named join point interfaces or JPI for the Java programming language is discussed. Also, the main differences and advantages of JPI over the classical methodology of aspect-oriented programming for Java (AspectJ) are analyzed with the aim of achieving a modular aspect-oriented programming. In addition, an extension of UML class diagram for the structural and conceptual design of JPI applications is proposed. As a study case, a programming example in AspectJ and JPI, along with a UML class diagram model of the study case, using the modeling proposed in this work, is presented. It is concluded that the proposed class diagram UML JPI allows defining an ingenuous class, an essential element for achieving a complete adaptation and transformation of aspect-oriented programming into JPI solutions.

En este trabajo se muestra el enfoque modular de programación orientada a aspectos de interfaces de puntos de unión o JPI para el lenguaje de programación Java, Se analiza también las principales diferencias y ventajas de JPI respecto a la metodología clásica de programación orientada a aspectos para Java (AspectJ) con el fin de obtener una programación orientada a aspectos de tipo modular. Adicionalmente, se propone una extensión del diagrama de clases UML para el diseño estructural y conceptual de aplicaciones JPI. Como ejemplo de aplicación, se presenta y describe un caso de programación en AspectJ y JPI, junto con un modelo de diagramas de clases UML del programa ejemplo, usando la propuesta de modelación de este trabajo. Se concluye que la propuesta de diagramas de clases UML JPI permite la definición de clases ingenuas, un elemento esencial para lograr una completa adaptación y transformación de soluciones de programación orientada a aspectos en soluciones JPI.